Σύμφωνα με το άρθρο 280 του ΚΔΣ, η διαχείριση της συμφόρησης στις διασυνδέσεις και η εκχώρηση ικανότητας μεταφοράς αυτών, η οποία διενεργείται στο πλαίσιο της ανωτέρω διαχείρισης, διέπεται από τις αρχές του Κανονισμού (ΕΚ)714/2009 σχετικά με τους όρους πρόσβασης στο δίκτυο για τις διασυνοριακές ανταλλαγές ηλεκτρικής ενέργειας.

Ο Διαχειριστής του Συστήματος εκχωρεί στους ενδιαφερόμενους ικανότητα μεταφοράς στις διασυνδέσεις σε χρονικό ορίζοντα έως ένα (1) έτος. Η εκχώρηση ικανότητας μεταφοράς στις διασυνδέσεις η οποία ολοκληρώνεται έως και την ημέρα που προηγείται της Ημέρας Κατανομής πραγματοποιείται μέσω εμφανών  διαγωνισμών (δυναμικότητας – «explicit auctions») σε ετήσια, εβδομαδιαία και ημερήσια βάση.

Έως την 1η Νοεμβρίου έκαστου έτους, ο Διαχειριστής του Συστήματος υποβάλει στη ΡΑΕ σχέδιο όρων και κανόνων που διέπουν τους διαγωνισμούς που διενεργούνται για την εκχώρηση ικανότητας μεταφοράς στις διασυνδέσεις το επόμενο ημερολογιακό έτος. Οι όροι και οι κανόνες εγκρίνονται με απόφαση της ΡΑΕ.

Η διαθέσιμη ικανότητα μεταφοράς στις διασυνδέσεις, η οποία εκχωρείται προς δέσμευση με τους διαγωνισμούς της παραγράφου (2) σε μακροχρόνια βάση από ένα (1) μήνα έως και ένα (1) έτος καθορίζεται με απόφαση της ΡΑΕ κατόπιν εισήγησης του Διαχειριστή του Συστήματος. Με την απόφασή της η ΡΑΕ δύναται να καθορίζει το μέγιστο επιτρεπόμενο ποσοστό δέσμευσης της διατιθέμενης στο διαγωνισμό ικανότητας μεταφοράς από έναν δικαιούχο συμμετοχής.

Ο Διαχειριστής του Συστήματος διαχειρίζεται τα έσοδα από το αντάλλαγμα που καταβάλλεται για τη δέσμευση ικανότητας μεταφοράς στις διασυνδέσεις για τους ακόλουθους σκοπούς όπως προβλέπονται από τον Κανονισμό 714/2009 (Αρθρο 16 του Κανονισμού και Άρθρο 6 του Παραρτήματος του Κανονισμού 714/2009):

Αν τα έσοδα δεν μπορούν να χρησιμοποιηθούν για του παραπάνω σκοπούς, μπορούν να χρησιμοποιηθούν μέχρι ένα ανώτατο ποσό που καθορίζεται με απόφαση της ΡΑΕ, ως έσοδα που απομειώνουν το κόστος χρήσης του δικτύου μεταφοράς κατά την έγκριση της μεθοδολογίας για τον υπολογισμό των τιμολογίων του δικτύου.  

Το Ελληνικό Σύστημα Μεταφοράς περιλαμβάνει διασυνδέσεις με την Αλβανία, την ΠΓΔΜ, τη Βουλγαρία, την Τουρκία και την Ιταλία. Στα πλαίσια της συνεργασίας με τους γειτονικούς διαχειριστές οι δημοπρασίες για τις διασυνδέσεις με την Αλβανία, την ΠΓΔΜ και την Τουρκία διενεργούνται από κάθε διαχειριστή για το ήμισυ της συνολικής διαθέσιμης ικανότητας μεταφοράς. Για τη διασύνδεση με τη Βουλγαρία, οι ετήσιες και οι ημερήσιες δημοπρασίες διενεργούνται από το Διαχειριστή της Ελλάδας ενώ οι μηνιαίες από το Διαχειριστή της Βουλγαρίας. Το σύνολο των δημοπρασιών που αφορούν τη διασύνδεση με την Ιταλία διενεργείται από τον CASC (Capacity Allocating Service Company).